Agustín Ciapponi es médico graduado en la Universidad de Buenos Aires (UBA); especialista en Clínica Médica y en Medicina Familiar. También es doctor en Salud Pública (UBA),máster en Efectividad Clínica (UBA) e Investigador principal del CONICET (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas)
Actualmente, se desempeña como director general de Cochrane Argentina y del Centro Cochrane IECS. Además, es director de cursos de posgrado de revisiones sistemáticas, metaanálisis y medicina basada en la evidencia.
Es docente de la Facultad de Medicina de la UBA y de la Maestría en Efectividad Clínica. Es médico de planta y docente del Servicio de Medicina Familiar y Comunitaria del Hospital Italiano de Buenos Aires.