Juan Pedro Alonso es licenciado en Sociología (2003) y doctor en Ciencias Sociales (2011) por la Universidad de Buenos Aires (UBA). Se ha desempeñado como becario doctoral y posdoctoral del Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) en el Instituto de Investigaciones Gino Germani, de la Facultad de Ciencias Sociales de la UBA.
Actualmente es investigador adjunto en el área Sociología y Demografía del CONICET, docente del curso de investigación cualitativa en salud del IECS e investigador de la Unidad de Investigación Cualitativa de la misma institución.
Ha dirigido y participado en proyectos de investigación en el campo de la sociología de la salud, en temáticas como el VIH/sida, cuidados en el final de la vida y derechos de los pacientes, entre otros. Una de sus áreas de interés es la metodología de la investigación en ciencias sociales, en especial en métodos de investigación cualitativa. Como consultor ha colaborado en investigaciones orientadas al diseño, la implementación y la evaluación de políticas de salud.